方春

 

方春,女,19814月出生,工学博士,副教授,硕士生导师,毕业于早稻田大学。现在信息工程学院工作。

主要研究领域为大数据分析、智能计算、生物信息学等研究。作为课题负责人完成国家自然科学基金青年基金1项、日本学术振兴会JSPS学者项目1项,山东省自然科学基金青年项目1项、山东大学重点实验室开放基金1项;参与国家自然科学基金和省部级项目6项;指导学生完成国家级大学生创新创业训练项目1项,共获得科研基金资助近90万元。发表科研论文30余篇,其中SCIEI收录论文期刊论文8篇。

讲授本科生课程《离散数学》、《linux操作系统》、《机器学习》等课程,并主讲研究生课程《深度学习》、《数据分析与R语言》等课程。

I. 主要研究工作

1. 图像、文本大数据分析和模式识别。

2. 智能计算方法在生物数据中的应用研究。

II. 承担科研项目

1. 日本国家基金--JSPS特别研究员项目:膜蛋白质天然变性领域的预测和分析(合作单位:东京大学)(项目号:P17050),项目负责人,2017.8-2019.8

2. 国家自然科学基金青年基金项目:天然无序蛋白质无序区域及其分子识别特征域的预测算法研究(项目号:61602280),项目负责人,2017.01-2019.12

3. 山东省自然科学基金青年基金项目:基于序列信息的天然无序蛋白质功能位点的预测(项目号:ZR2014FQ028),项目负责人,2015.01-2017.12,

4. 山东省软件工程重点实验室(山东大学)联合开放基金项目、固有无序蛋白质功能位点的识别研究。项目负责人,2016.10-2018.09.

III. 代表性学术论文

  1. Chun Fang, Yoshitaka Moriwaki, Caihong Li and Kentaro Shimizu. MoRFPred_en: Sequence-Based Prediction for MoRFs Using an Ensemble Learning Strategy [J], Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2020, 17(6):1-15.

  2. Chun Fang, Yoshitaka Moriwaki, AikuiTian, Caihong Li and Kentaro Shimizu.Identifying short disorder-to-order binding regions in disordered proteins with a deep convolutional neural network method [J]. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2019, 17(1):1-16.

  3. Chun Fang, Yoshitaka Moriwaki, Caihong Li, and Kentaro Shimizu, Prediction of Antifungal Peptides by Deep Learning with Character Embedding[J]. IPSJ Transactions on Bioinformatics. 2019,12:21-29.

  4. Chun Fang, Tamotsu Noguchi and Hayato Yamana. Condensing position-pecific scoring matrixs by the Kidera factors for ligand-binding prediction[J]. International Journal of Data Mining and Bioinformatics. 2015, 12(1), 70-84.

  5. Chun Fang, Tamotsu Noguchi and Hayato Yamana, Simplified Sequence-based method for ATP-binding Prediction Using Contextual Local Evolutionary Conservation [J], Algorithms for Molecular Biology, 2014, 9(7):1-16.

  6. Chun Fang, Tamotsu Noguchi and Hayato Yamana, Conservation Patterns of proteins and Its Influence on Identifying Protein Functional Sites [J]. Journal of Bioinformatics and Computational Biology,2014,12(5) 1440003:1-18.

  7. Chun Fang, Tamotsu Noguchi and Hayato Yamana, MFSPSSMpred: Identifying short disorder-to-order binding regions in disordered proteins based on contextual local evolutionary conservation [J]. BMC bioinformatics, 2013,14 (300):1-16.

  8. Chun Fang, Tamotsu Noguchi and Hayato Yamana, SCPSSMpred: A General Sequence-based Method for Ligand-binding Site Prediction [J], IPSJ Transactions on Bioinformatics, 2013, 6: 35-42.

IV. 招生信息

本人主要招收控制科学与工程学术学位硕士(0811)、电子信息专业学位硕士(0854)。诚挚欢迎踏实认真、敢于创新、具备较强计算机应用能力和较高英语水平的同学加入本团队。

 

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